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毫不妥协地获得高质量丙烯酰胺凝胶

时间:2024-04-02 17:30:05 来源:
导读 右研究人员经常使用十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)根据分子量分离蛋白质,从而分析细胞样品中的蛋白质多样性或特定蛋白质水平...

右研究人员经常使用十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)根据分子量分离蛋白质,从而分析细胞样品中的蛋白质多样性或特定蛋白质水平。科学家需要高质量的丙烯酰胺凝胶来实现下游应用(例如质谱和蛋白质印迹)所需的理想蛋白质分离。1,2尽管它们很重要,但研究人员主要有两种选择:购买预制凝胶或手动铸造凝胶。然而,这些选项具有明显的优点和缺点。

在成本和时间之间进行选择

由于成分成本相对较低,自制丙烯酰胺凝胶是最经济的选择。科学家可以以与单个预制凝胶相同的价格生产大量手工浇注凝胶,这使得自制选项成为每周使用大量凝胶的实验室的理想选择。3此外,自行制备凝胶的研究人员可以定制丙烯酰胺的百分比,以最好地解析其感兴趣的蛋白质,其中高丙烯酰胺百分比最好分离低分子量的蛋白质,反之亦然。3相反,市售预制凝胶仅提供选定的丙烯酰胺百分比,这可能不适合研究特定蛋白质。自制的选择还允许科学家根据需要准备凝胶,而不是要求研究人员预先计划未来几个月所需的预制凝胶的数量。

尽管手工浇注凝胶比预制凝胶便宜得多,但研究人员必须忍受耗时的多步骤过程来手动生成丙烯酰胺凝胶,其中包括称量试剂、混合、浇铸并等待溶解凝胶聚合。他们对浓缩凝胶重复该过程。由于科学家手动完成这些步骤,因此他们有很多机会在凝胶中产生不一致的情况,而这些问题更有可能发生在缺乏经验的研究人员身上。此外,这些问题迫使科学家重新制作丙烯酰胺凝胶,这可能会抵消手工制作凝胶所节省的任何资金,并迫使它们进一步接触有毒化学物质,包括丙烯酰胺、四甲基乙二胺(TEMED)和过硫酸铵(APS)。另外,预制凝胶是可靠、一致、即用型产品,可产生可发表的结果。因此,当研究人员的蛋白质样品太珍贵而无法冒因手工浇注凝胶而导致实验失败的风险时,他们会选择预制凝胶。

寻找中间立场

直到最近,科学家们还需要在使用手工凝胶节省的成本和使用预制凝胶节省的时间之间做出选择。MilliporeSigma的mPAGE®Lux流延系统在成本和时间之间取得了平衡。通过紫外线照射,该系统只需90秒即可同时聚合微型凝胶的分离部分和堆积部分,这使得科学家能够在三分钟内从开始到完成浇注凝胶。因此,这为研究人员节省了大量时间,因为手工铸造的准备和固化步骤通常需要两到三个小时。3

此外,预先制备的分离和堆积凝胶溶液消除了称量试剂所花费的时间,同时仍然保留了手工浇铸凝胶的灵活性,因为科学家可以将分离溶液稀释到所需的丙烯酰胺百分比。与典型的基于Tris-甘氨酸的凝胶不同,mPAGE®LuxCasting系统在其凝胶溶液中采用pH中性Bis-Tris,这使得研究人员能够获得更清晰的条带并缩短凝胶的运行时间。该系统还使用无害的光引发剂代替APS和TEMED,这使得这种凝胶注模方法比传统的手工注模工艺更安全。

除了这些优点之外,该系统还为研究人员节省了资金,因为通过这种方法生成的凝胶比市售的预制凝胶更便宜。然而,这并不以牺牲凝胶的可靠性为代价,因为该系统可产生高质量、一致的凝胶,从而最大限度地减少凝胶失败和宝贵的样品损失。总体而言,mPAGE®Lux浇注系统使研究人员能够分别花费手工浇注和预制凝胶一小部分的时间和金钱获得出版质量的结果。

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