粪便微生物群移植是治疗艰难梭菌反复感染的最有效且经济实惠的治疗方法，艰难梭菌是一种机会性细菌，也是医院获得性肠道感染的最常见原因。然而，通过粪便微生物群移植(FMT)治疗溃疡性结肠炎和代谢综合征等慢性非传染性疾病的尝试取得了喜忧参半的结果。
5月10日发表在CellHost&Microbe杂志上的两篇评论文章讨论了关于FMT为什么起作用(当它们起作用时)我们知道什么和不知道什么。
两个研究团队都同意，我们需要更多地了解各种未充分探索的因素——例如患者的饮食和遗传背景、捐赠者的微生物组成与患者现有微生物组的匹配程度，以及非细菌肠道居民如真菌的存在和病毒——影响FMT的成功。
“为了加深我们对FMT机制的理解并确定因果关系，人类干预试验不仅使用粪便，还使用具有确定成分和特征的粪便衍生物，或者单独或组合使用确定的细菌、病毒和代谢成分联合体，将作为重要的实验平台，”伊朗沙希德贝赫什蒂医科大学的微生物学家、第一篇评论的主要作者AbbasYadegar写道。
“将尖端技术应用于微生物组评估，以及当前粪便移植愿景的变化，有望改善FMT方案和结果，”FondazionePoliclinicoUniversitarioGemelli和UniversitàCattolicadelSacro的胃肠病学家SerenaPorcari写道领导第二次审查的Cuore。
大多数FMT研究都集中在微生物组的细菌成分上，但病毒和真菌也可能发挥作用。一项移植无菌(即无菌)粪便材料的研究表明，细菌甚至可能不是移植成功治疗艰难梭菌所必需的。真菌的作用受到的关注更少，但念珠菌在供体或受体中的存在与治疗效果降低有关。
研究人员说，更多地考虑我们如何选择捐赠者并将他们与患者配对可能会改善移植结果。从历史上看，科学家和医学专家只是简单地选择“健康”的捐赠者，但两个研究小组都表示，对捐赠者和接受者微生物组的精细分类和代谢分析将有助于临床决策，特别是在治疗艰难梭菌感染以外的疾病时.尽管还需要更多的研究，但甚至可能需要采用个性化的方法来选择供体-患者配对。
“虽然一些研究支持构成‘超级捐赠者’的共同特征的存在，但其他研究发现最佳捐赠者更具患者特异性，因此需要在微生物组测序工具的帮助下制定个性化选择策略，而不是‘一个’凳子适合所有人的方法，”Porcari及其同事写道。
Yadegar及其同事写道：“根据他们的饮食模式和偏好将供体-受体组合配对可以进一步优化疗效，因为供体微生物群会预先适应受体的饮食。”
最终，一旦我们了解了FMT成功背后的机制，Yadegar及其同事认为我们应该利用这些信息来设计新的标准化疗法来取代FMT。“虽然非常有效，但粪便微生物群移植有很多缺点，包括感染风险和稀疏的长期安全数据，”作者写道。“因此，需要针对复发性艰难梭菌感染的更好的治疗选择，这些选择是有针对性的、安全的和不依赖供体的。”
GianlucaIaniro(Porcari博士所属)的研究团队乐观地认为，我们可能能够改进FMT作为其他疾病的治疗方法，尽管我们仍然有一些障碍需要首先克服。作者写道：“我们认为，除了技术改进之外，还需要一些思维方式转变来推动FMT作为非传染性疾病的潜在治疗选择。”
这些思维转变包括认识到需要并实施对供体和患者微生物进行深入的微生物分析，超越FMT作为急性一次性疗法的范式。
“对于慢性非传染性疾病，对FMT的反应通常不会长期持续，”Porcari及其同事写道。“因此，顺序移植已应用于这种情况并取得了可喜的结果，这表明患者微生物组的慢性调节可能对非传染性慢性疾病有益。”