导读 Allain(IBC)、Gossert(BNSP)和Leitner(IMSB)小组通过混合结构确定方法研究了SARS-CoV-2核衣壳蛋白RNA相互作用的成药性，从而确定了初级片段
Allain(IBC)、Gossert(BNSP)和Leitner(IMSB)小组通过混合结构确定方法研究了SARS-CoV-2核衣壳蛋白RNA相互作用的成药性，从而确定了初级片段命中。他们的发现发表在NucleicAcidsResearch上。
除了有效的疫苗，抗病毒化合物代表了对抗病毒性疾病的基本方法。由FrédéricAllain、AlvarGossert和AlexanderLeitner领导的D-BIOL小组研究了具有两个已知RNA结合结构域的SARS-CoV-2核衣壳蛋白与位于SARS3'UTR的sm2RNA之间的相互作用-CoV-2RNA可能是可药用的。
他们选择了一种基于溶液NMR实验和交联MS的混合结构方法，以快速获得这些复合物的结构信息。然后使用此信息生成约束以构建sm2RNA和核衣壳蛋白的两个RNA结合域的复合物模型，之前解决了未结合的结构。这种方法产生了第一个RNA结合域如何与RNA相互作用的模型，并扩展了对另一个RNA结合域的了解。
然后使用基于NMR的片段筛选来识别与两个蛋白质结构域之一或分离的RNA结合的化合物。从这些化合物中，选择了与各个分子的相互作用界面结合的化合物，这些分子从混合结构方法模型中已知。总的来说，实验表明这些蛋白质RNA相互作用似乎可以作为药物。因此，已鉴定的化合物为开发抑制这些蛋白质-RNA相互作用的更有效分子提供了基础。